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The Imprinted H19 LncRNA Antagonizes Let-7 MicroRNAs
日期:2017-07-26 標簽:LncRNA,ceRNA,microRNA,Let-7
LncRNA 的CeRNA機制研究案例(三)
(一)調控通路:

當LncRNA H19低表達時(shí)microRNA Let-7結合ago2到mRNA的3’-UTR抑制蛋白表達,當LncRNA H19高表達時(shí)LncRNA H19與microRNA Let-7,促進(jìn)mRNA翻譯表達蛋白。
(二)實(shí)驗流程:

作者首先用生物信息學(xué)分析預測了LncRNA H19與Let-7的結合位點(diǎn),然后進(jìn)行熒光素酶實(shí)驗驗證H19與Let-7的結合。Ago2-RIP實(shí)驗獲得與ago2蛋白結合的RNA后進(jìn)行Q-PCR檢測驗證了H19和Let-7都與ago2結合。隨后,通過(guò)H19過(guò)表達/敲低,Let-7敲低檢測下游靶標的表達,然后再一次進(jìn)行熒光素酶實(shí)驗驗證H19與Let-7結合。最后檢測H19和Let-7對細胞分化的影響。
(三)核心FIGURE:


Figure1 說(shuō)明的是H19與Let-7相互結合。
A、Let-7受體的熒光素酶報告質(zhì)粒構建策略。
B、熒光素酶活性檢測,分別將Let-7受體和H19熒光素酶報告質(zhì)粒與let-7轉染細胞,檢測熒光素酶活性,結果表明H19與Let-7結合。
C、熒光素酶活性檢測,將Let-7受體熒光素酶報告質(zhì)粒和H19表達質(zhì)粒共轉染細胞,檢測熒光素酶活性,結果表明H19與Let-7受體競爭結合Let-7。
D、 Ago2-RIP,用ago2抗體釣取與蛋白結合的RNA,然后進(jìn)行q-pcr檢測,結果表明H19能與ago2結合。
E、Ago2-RIP,用ago2抗體釣取與蛋白結合的RNA,然后進(jìn)行q-pcr檢測,結果表明H19、Let-7與ago2結合。

Figure2說(shuō)明的是H19作為Let-7的海綿吸附體促進(jìn)下游靶標基因的表達。
A、 H19過(guò)表達之后,分別用q-pcr和WB檢測下游靶標的Mrna和蛋白的表達以及Let-7的表達,結果表明H19過(guò)表達不影響mRNA和Let-7的表達,而蛋白的表達量升高。
B、 Let-7敲低后分別用q-pcr和WB檢測下游靶標的mRNA和蛋白的表達,結果表明Let-7敲低不影響mRNA的表達,而蛋白的表達量升高。
C、 H19敲低后分別用q-pcr和WB檢測下游靶標的mRNA和蛋白的表達,結果表明Let-7敲低不影響mRNA的表達,而蛋白的表達量升高。
本公司可提供的技術(shù)服務(wù)
本公司可進(jìn)行以上類(lèi)似實(shí)驗的實(shí)驗設計及整體實(shí)驗外包項目,包括Q-PCR、Western Blot、Luciferase檢測、慢病毒穩轉株的建立(過(guò)表達/敲低)、ago2-RIP,其中的Luciferase檢測、RIP、ago2-RIP為本公司主營(yíng)項目。
一、 Luciferase檢測:檢測mRNA的3’-UTR或LncRNA與microRNA的關(guān)系。

本實(shí)驗檢測的是LncRNA與microRNA的關(guān)系,分別將Let-7受體和H19熒光素酶報告質(zhì)粒與let-7轉染細胞,檢測熒光素酶活性,結果表明H19與Let-7結合。Let-7受體作為對照。
二、Ago2-RIP:主要研究ago2蛋白與RNA的相互作用

本實(shí)驗是用ago2蛋白抗體釣取與ago2結合的RNA,然后進(jìn)行q-pcr檢測表明ago2與H19結合。我公司在實(shí)驗體系中設置陽(yáng)性及陰性對照,進(jìn)一步排除系統誤差。
參考文獻:Amanda N. Kallen, Xiao-Bo Zhou, Jie Xu,et al. The Imprinted H19 LncRNA Antagonizes Let-7 MicroRNAs[J]. Molecular Cell,2013, 52, 101–112
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