CLIP實(shí)驗技術(shù)

Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色質(zhì)免疫沉淀，是一項體內研究RNA分子與RNA結合蛋白相互作用的革命性技術(shù)。其主要原理是基于RNA與其相應的RNA結合蛋白會(huì )在紫外照射下會(huì )發(fā)生共價(jià)結合，以RNA結合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，進(jìn)行qRT-PCR檢測或測序分析。最近，這項技術(shù)也被應用于microRNA的靶標鑒定。

在CLIP實(shí)驗過(guò)程中我們設置一系列的質(zhì)控標準以確保每一步實(shí)驗的真實(shí)有效，如WB驗證抗體和蛋白表達、CLIP產(chǎn)物RT-PCR跑膠圖。具體示例如下圖所示：

      WB檢測抗體的效果以及處理和未處理組細胞蛋白的表達。

CLIP實(shí)驗產(chǎn)物可進(jìn)行高通量測序或者進(jìn)行dot blot檢測。

• 1 . 基因表達調控
  • 1.1. 表觀(guān)遺傳修飾調控
  • 1.2. 轉錄水平調控
  • 1.3. 轉錄后水平調控
• 2 . 基因表達調控實(shí)驗技術(shù)
  • 2.1. CHIP 染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)
  • 2.2. RIP RNA結合蛋白免疫沉淀技術(shù)
  • 2.3. CHIRP 免疫共沉淀實(shí)驗
  • 2.4. CLIP實(shí)驗技術(shù)
  • 2.5. RNA pull-down
  • 2.6. DNA pull-down
  • 2.7. RNA-RNA pull-down
  • 2.8. Luciferase 熒光素酶實(shí)驗
  • 2.9. DNA/RNA EMSA 凝膠電泳遷移實(shí)驗
  • 2.10. FISH 免疫熒光原位雜交技術(shù)
  • 2.11. ?核質(zhì)分離